Biologija celice, izpit

15.3.2008

1. Z G-proteini povezani receptorji.
2. Opiši trans-Golgijevo omrežje.
3. Zgodnji in pozni endosomi, opiši.
4. Opiši regulacijo celičnega cikla z G1-Cdk, G1/S-Cdk in S-Cdk.
5. Razlike med apoptozo in nekrozo.
6. Opiši lastnosti monomernega polipeptida in faze v nastajanju intramediarnih filamentov.

15.2.2008

1. Naštej in razloži vse oblike transporta kalcija v celici.
2. Sestava in usoda endocitotskih klatrinskih veziklov.
3. Opiši kotranslacijo na ER.
4. Dogodki po vezavi liganda na Fas receptor (receptor smrti).
5. Na primeru aktivacije trombocita opiši reorganizacijo aktinskih filamentov, ki sodelujejo pri celjenju ran.
6. Kako mitogeni vplivajo na celično delitev.

13.3.2007

1. Na primeru prehoda trombina iz neaktivne oblike v aktivno obliko razloži pomen akcesornih proteinov pri povezovanju aktinskih filamentov.
2. Podenote iniciacijskih kaspaz. Podenote, sestava iniciacijske kaspaze, aktivacija iniciacijske kaspaze v aktivno kaspazo.
3. Poškodbe DNA z UV sevanjem v G1 fazi celičnega cikla. Potek ustavitve cikla.
4. CopII plašč. Zgradba, pomen, nastanek.
5. Vloga Srp delcev.
6. Ras protein in tirozinska kinaza. Kaj to je, delovanje, pot.

16.5.2006

1. Transport kalcija v srčnih mišičnih celicah.
   a) Kolikšna je koncentracija kalcija v celici in njeni okolici?
   b) Načini transporta.
   c) Kaj se dogaja s kalcijem v celici?
2. Naštej poddružine iz družine proteinov Bcl-2, katere so njihove skupne značilnosti in napiši, kakšno vlogo imajo pri apoptozi.
3. Opiši vlogo proteinov gama-tubulina, statmina, katastrofina, katanina in MAP.
4. Model nastanka COPII plašča. Kdaj se COPII odcepi od vezikla?
5. Po dodatku fenobarbituratov je pri podgani prišlo do proliferacije gladkega endoplazmatskega retikuluma (gER). V katerih celicah je prišlo do proliferacije gER in zakaj?
   Kaj se zgodi s presežkom gER po prenehanju dodajanja pomirjeval?
6. Katere celice so v G₀ fazi celičnega cikla in zakaj? Kateri so signali za prehod v G₁ fazo?

14.3.2006

1. Opiši eno- in dvosmerni replikon ter navedi glavne proteine, ki so udeleženi pri replikaciji.
2. Vloga Rb proteina pri regulaciji celičnega cikla.
3. N-glikozilacija: v katerem celičnem kompartmentu in kako poteka? Kaj je O-glikozilacija in v katerem kompartmentu poteka?
4. Potek receptorske endocitoze LDL partiklov.
5. Na primeru aktivacije trombocita opiši vlogo akcesornih proteinov pri preurejanju aktinskih filamentov.
6. Kaspaze - iz katerih podenot so zgrajene? Opiši zgradbo podenot. Kako iz prokaspaz nastanejo aktivne kaspaze?

13.9.2005

1. Ionski transport čez membrano želodčnega epitela (skiciraj, opiši, označi gradiente, zakaj je pomemen ta transport).
2. Substrati M-faze.
3. Preko Caspaze 8 sta možni dve poti apoptoze. Kako in zakaj gre mitohondrijska pot?
4. - SRP
   - LDL partikel, zgradba
   - zgodnji endosom, zgradba, funkcija
   - proteini pri nastanku LDL
5. Aktinski filamenti, razloži delovanje:
   - Arp2/3
   - Gelsolin
   - Timozin
   - Profilin
   - Spektrin
   - Kofilin

18.5.2005

1. Integrini: zgradba, struktura dimerov, afiniteta do povezav, regulacija povezovanja.
2. Regulacija celičnega cikla v metafazi: normalni potek, odstopanja
3. Bcl2 proteini:
   - Naštejte vse poddružine in za vsako vsaj po enega predstavnika.
   - Kaj je skupno vsem?
   - Vloga Bcl2 proteinov pri apoptozi.
   - S katerim organelom je povezana njihova funkcija?
   - Katera molekula izhaja iz tega organela ob posredovanju Bcl2?
4. Mikrotubuli:
   - Kako se imenuje struktura, ki je pri živalih odgovorna za organizacijo mikrotubulov? Kako je zgrajena?
   - Kako je zgrajen molekularni kompleks, ki sodeluje pri nukleaciji mikrotubulov?
   - Vloga hidrolize GTP pri beta-tubulinu.
   - Kakšno vlogo imata statin in katastrofin?
   - Kateri motorni proteini sodelujejo pri anterogradnem transportu po mikrotubulih?
5. Kljub chaperonom se mnogi proteini napačno zvijejo. Kakšna je usoda teh proteinov?
6. Različni koraki pri modifikaciji oligosaharidov na glikoproteinih se dogajajo v različnih kompartmentih Golgijevega aparata. Kakšna je vloga različnih funkcionalnih enot GA pri tem procesu?

15.3.2005

1. Potovanje glukoze čez membrano črevesne celice. Skiciraj in opiši.
2. Vloga mikrotubulov pri mitozi. Nekaj v zvezi z regulacijo metafaze in anafaze.
3. Povej:
   - kje, zakaj in lastnost signalnega zaporedja
   - vloga dolihola
   - kje se nahaja signalna peptidaza
   - ...
4. Razpredelnica: Kateri plašč se tvori in kam potujejo vezikli, ki prihajajo iz: ER, plazmaleme, cis GA omrežja, trans GA omrežja.
5. Kaj so SNARE proteini?
6. APOPTOZA:
   a) Delitev kaspaz glede na funkcijo
   b) Kdaj kaspaza 8 vpliva na cepitev Bid?
   c) Domene FAS receptorja in s katerimi domenami se povežejo
   d) Kaj je apoptotično telo?
7. Katere strukture tvorijo aktinski filamenti?
8. Kateri proteini jih sestavljajo (AF)?
9. Kakšno vlogo imajo te strukturo v celici?
10. Strukturne in funkcionalne razlike med miozinom 1 in 2.

16.9.2004

1. Presledkovni stiki:
   - kaj so?
   - zgradba oz. sestavni deli
   - regulacija (s Ca²⁺ - orprto, zaprto)
   - mutacije, posledice & na kakšen način se kažejo
2. Celični cikel:
   - dogajanje med metafazo in anafazo
   - regulacija teh dogodkov (MPF,...)
3. ER:
   - naštej rezidentne proteine ER, ki imajo vlogo chaperonov in opiši njihovo funkcijo
   - proteini, ki se vračajo is cis-GA nazaj v ER (potovanje ER rezidentnih proteinov)
   - nastanek N-oligosaharidov
   - zakaj morajo biti proteini pravilno zviti, ko zapuščajo ER?
4. Nastanek lizosoma s hidrolitičnimi lizosomskimi encimi (vse od ER naprej -> N-oligosaharidi visokomanoznega tipa v cis GA -> ...)
5. Vloga timozina, profilina, kofilina in ARP 2/3
6. Vloga mitohondrijev v apoptozi (Bcl 2 superfamilija + citokrom C)

18.5.2004

1. Prehajanje kalcijevih ionov v prečnoprogasti mišici.
2. Vloga CAM pri potovanju levkocitov v krvnih žilah.
3. Zgradba GA in vloga posameznih delov (kaj se dogaja).
4. Mikrotubuli (zgradba, dinamična stabilnost, vloga statmina ipd.)
5. Apoptoza (vloga Bcl2, kateri organel sodeluje in kako, BH sekvence ipd.)
6. Nastanek COPII plašča in kako razpade.

Maj 2004

1. Prehajanje levkocita preko endotelija
2. Zgradba in funkcije GA
3. Mikrotubuli: kje nastajajo, kako nastajajo, kateri proteini sodelujejo pri anterogradnem transportu, kaj delata katastrofin in ...?
4. Apoptoza: Katere družine Bcl2 poznamo, kaj jim je skupno, na kaj delujejo, kje jih najdemo v celici?
5. COP1; molekule, ki pomagajo pri nastanku vezikla, kako vezikel nastane, kako/zakaj razpade?
6. Ca⁺⁺ črpalka v SER

16.09.2003

1. Razpravljaj o vlogi mitohondrijev pri apoptozi.
2. Vloga: timozina, profilina, kofilina in Arp2/3
3. Kadherini in selektini - zgradba, način povezovanja, vloga pri procesih v celici.
4. N-glikozilacija sekretornih proteinov.
5. Vloga: ciklina B, Rb proteina, p53, p21
6. Vloga: Sec61, PDI (fosfo disulfid izomeraza), KoatomereII, Adaptina

13.5.2003

1. Prenos Ca preko plazmaleme in membrane ER
2. Dogodki v metafazi, anafazi in vloga kontrolne točke
3. Lastnosti caspaz, opiši delovanje na primeru
4. Fibroblast v kulturi: dogodki v celici po sprejetju signala (nekaj podobnega)
5. Vloga SRP partikla
6. Naštej:
   - kateri proteini sodelujejo pri transportu veziklov iz GA v lizosom?
   - kje se označijo kisle hidrolaze?
   - zakaj pride do hiperholerostemije?
   - (še nekaj)

11.3.2003, 60 min (!)

1. Lizosom - nastanek in funkcije
2. Kateri proteini sodelujejo pri transportu veziklov od ER do GA?
3. Tesni stik - kateri sta dve pomembni funkciji in kakšne posledice to ima na tkiva?
4. Katere so stop kontrolne točke v celičnem ciklu in kaj se v posamezni točki preverja?
5. Opiši pot aktivacije kaspaz preko FAS liganda (treba je znat vse podenote komponent!)
6. Opiši mitohondrijsko pot aktivacije kaspaz
7. Mikrotubuli - vse živo (kje nastajajo, pomožni proteini pri njihovi stabilizaciji, kaj pomeni odcep GTP z beta tubulina, kaj je gama TuRC, kateri motorni proteini sodelujejo pri retrogradnem transportu pri nevronu...)

14.5.2002 pisni izpit za mikrobiologe

1. Mikrotubuli: gama-tubulin, vloga MAP proteinov, zgradba aksoneme, dinamična nestabilnost MT
2. Prenašalni vezikli: tipi; stopnje vnašanja holesterola v celico od nastanka LDL partikla do razgraditve LDL, sprostitve holesterola; kaj omogoča prepoznavanje med receptorjem in substratom (v/t snare)?
3. Natrij-kalijev kanal: zgradba, delovanje, nahajanje?
4. MPF-mitozni promocijski faktor: zgradba, kdaj je pomemben, delovanje?
5. Tesni stik: zgradba (molekularna), nahajanje, funkcije?

14.5.2002 pisni izpit, 50 min

1. Transmembranski proteini: znachilnosti; GPI sidrani proteini
2. Integrinski rezeptorji: sgradba, povesovanje na zitossolni strani
3. Kako rastni faktorji sprosijo proliferazijo
4. Krovni in zepitveni proteini aktinskih vilamentov
5. Intermediarni filamenti: skupne snachilnosti monomerov, po chem se lochijo od aktinskih vilamentov in mikrotubulov, fase sestavljanja
6. Caspaze: sploshne snachilnosti, vrste caspaz, kako zytokrom C sprozhi apoptozo
7. Vloga adaptinov
8. Mehanisem vesave ribosoma na ER
9. Modifikazija N-glikosiliranih proteinov v ER, cis GA omresju in cis GA zisterni ter v trans GA omresju

12.3.2002 pisni del, 45 min

1. Razloži transport glukoze v enterocitah!
2. Kaj se zgodi na meji med metafazo in anafazo, katere so kontrolne točke in možne posledice?
3. Razlika med cis in trans delom Gš
4. Zakaj določeni oligopeptidi imajo konce modificirane z encimi GA (pot ER--> GA)?
5. LDL jamica: nastanek, kje razpade in zakaj!
6. IF: v čem se razlikujejo od ostalih delov citoskeleta (MT & AF), postopek nastajanja in naštej tipe!
7. CASPAZE: kaj so, kaj delajo, regulacije na primeru caspaze 8

18.9.2001

1. Intermadiarni filamenti - nastanek, tipi
2. CASPAZE - tipi
3. Timozin, profilin, g-protein: funkcije
4. Posttraslacijska modifikacija sekrecijskih proteinov ER
5. Transport Ca₂⁺ - plazmalema, sER...
6. Povezovanje polariziranih celic. Lateralna stran, bazalna stran.
7. Proteini pri zbiranju, transportu in nastanku veziklov.
8. Gibalni proteini pri mitozi.
9. Lizosomi - funkcija in zgradba

Vprašanja zadnjih izpitov pri predmetu Biologija celice (predavatelji: Jezernik, Sterle, Pšeničnik)
Izpit je pisen in traja 45 min.

1. Pritrditev proteinov na lipidni dvosloj (6 načinov)
2. Glukoza v črevesnem epitelu - transport (nariši)
3. Ca-črpalka v plazmalemi in ER (konc. v celici, kalmodulin)
4. Adherentni stiki, dezmosomi, hemidezmosomi (Alberts str.958!)
5. Kaj so integrini in kaj kadherini

1. SRP partikel
2. Razvrščanje lizosomskih hidrolaz v GA
3. Obdelava hidrolaz v GA
4. Sinteza fosfolipidov
   • kje so encimi
   • vloga translokatorjev
   • kaj vpliva na zgradbo membrane
5. Kaj se dogaja z receptorji po vnosu snovi (endocitozi)

1. Zgradba intermediarnih filamentov (pomožni proteini, vloga v celici)
2. Nastanek mikrotubulov - dinamična nestabilnost
3. Signaliziranje na daljše razdalje (intracelularno signaliziranje, organizator)
4. Miozin I, miozin II - zgradba (razlike), funkcija v mišični celici
5. Apoptoza - spremembe v celici

1. LDL partikel
2. Stopnje procesiranja sekrecijskih proteinov v ER
3. Konstitutivna, receptorska sekrecija
4. Kako poteka glikozilacija preko dolihola in kje
5. Kako se ustvari kisel pH v Lys
6. Razlike med determinacijo in diferenciacijo

1. Kolhicin, taksol - učinki in način delovanja
2. Kako se v celici povezujejo aktinski filamenti in kateri akcesorni proteini sodelujejo
3. Dezmosom, hemidezmosom
4. Osnovne stopnje apoptoze in pomen genov ced3in ced9 ter homologi pri sesalcih
5. Naštej nekaj peroksisomskih encimov in kako pridejo v peroksisom

1. Kaj je fluidnost in od česa je odvisna
2. Na/K ATPaza
3. Naštej tipe ionskih črpalk in lastnosti
4. Ekstracelularna koncentracija Ca, kako se ustvari razlika, kje je v celici zaloga Ca
5. Kako se razlikuje jedrna lamina od IF
6. Fokalni stiki in pomen

Rok - 13.3.2000

1. Obrazloži prenos najpomembnejših ionov čez membrano v želodčnem epitelu
2. Vloga povezovalnih proteinov pri vnetni reakciji (limfociti/endotel)
3. Vloga Rb-proteina v celici
4. INTERMEDIARNI FILAMENTI - zgradba in tipi
5. MIOZIN - tipi, vloga v celici in zgradba, mehanizem kontrakcije
6. CASPAZE - vloga v celici in aktivacija z Fas-receptorjem
7. Vloga gER pri sintezi skrecijskih proteinov
8. Modifikacija in razvrščanje lizosomskih proteinov v GA
9. Tvorba in zlivanje veziklov z membrano pri nespecifični sekreciji

Maj 2001

1. Tesni stiki: kateri proteini jih gradijo in kakšni sta funkciji?
2. Integrini: zgradba (označi na skici podenote) in na katere proteine se vežejo.
3. Kateri procesi in vloga: SRP partikel, SNARE, dinamin, GlcNAc,...
4. Vloga Rb proteina
5. CASPAZE - značilnosti in vloga
   - caspaze in mitohondriji
6. Potek glikozilacije v ER
7. Poimenuj proteine, ki se povezujejo z aktinskimi proteini ter značilnosti povezav v epitelnih celicah in prečno-progasti mišici
8. Zgradba, značilnosti in vloga citosolnega in aksonemnega proteina

September 2001

1. Intermadiarni filamenti- nastanek, tipi
2. CASPAZE- tipi
3. Timozin, profilin, g-protein: funkcije
4. Posttraslacijska modifikacija sekrecijskih proteinov ER
5. Transport Ca2+ - plazmalema, sER...
6. Povezovanje polariziranih celic. Lateralna stran, bazalna stran.
7. Proteini pri zbiranju, transportu in nastanku veziklov.
8. Gibalni proteini pri mitozi.
9. Lizosomi - funkcija in zgradba

Digitalizirali Tine Grebenc, Janez Prešern, Jernej Polajnar, Konstantin

Nazaj | Na vrh strani